Mestrado em Bioinformática para Genômica Computacional

O Mestrado ("Laurea Magistrale") em "Bioinformática para Genômica Computacional " é uma iniciativa conjunta da Universidade de Milão e do Politecnico di Milano , e será ativado a partir do Ano Acadêmico 2019-2020.

No geral, pretende formar "cientistas de dados do genoma" , isto é, graduados que terão um conhecimento adequado sobre as bases moleculares dos sistemas biológicos; a estrutura e função das moléculas biológicas e como elas participam dos processos celulares; as tecnologias e plataformas para a análise de genomas; as ferramentas para bioinformática e análise genômica; e as metodologias estatísticas e computacionais para a análise de dados biomoleculares.

A admissão é aberta a todos os estudantes com um grau de bacharel ("Laurea Triennale"), quer em biologia ou biotecnologia ou semelhante, ou ciência da computação, engenharia, matemática ou física.

Ao participar dos cursos ministrados no grau BCG, você aprenderá sobre:

1. A organização da informação no genoma e os processos moleculares e celulares na base da expressão gênica e sua regulação.
2. Os métodos experimentais usados para estudar genes e sua função em diferentes espécies modelo, tanto procarióticas como eucarióticas.
3. As tecnologias empregadas na moderna pesquisa genômica e epigenômica, como ensaios baseados em sequenciamento de próxima geração (sequenciamento de genoma e exoma, sequenciamento de RNA, ChIP-Seq e assim por diante).
4. Métodos e protocolos de análise bioinformática em estudos de genômica funcional (sequenciamento de genoma e exoma, sequenciamento de RNA, ChIP-Seq, etc.).
5. As abordagens algorítmicas, matemáticas e estatísticas subjacentes às ferramentas de bioinformática e análise genômica.
6. Tecnologias de banco de dados para armazenamento e organização dos dados.
7. Técnicas de modelagem e análise empregadas em biologia de sistemas para o estudo de interações em sistemas biológicos complexos.

O programa inclui, como um passo fundamental na formação dos estudantes, um estágio em laboratórios de pesquisa na Universidade de Milão, no Politécnico ou em outros institutos de pesquisa italianos ou estrangeiros. A experiência de pesquisa do estágio e seus resultados serão descritos em uma dissertação final escrita, a ser discutida em frente ao comitê de tese.

Missão e Objetivos

O Mestrado conjunto em “Bioinformática para Genômica Computacional” (BCG) do Politecnico di Milano e da Università Degli Studi di Milano visa dar aos seus graduados um conhecimento adequado na base molecular dos sistemas biológicos; a estrutura e função das moléculas biológicas e como elas participam dos processos celulares; as tecnologias e plataformas para a análise de genomas; as ferramentas de bioinformática e análise genômica; e as metodologias estatísticas e computacionais para a análise de dados biomoleculares.

Portanto, o grau BCG inclui atividades que fornecem conhecimento aprofundado sobre:

• A organização da informação no genoma e os processos moleculares e celulares na base da expressão gênica e sua regulação.
• Os métodos experimentais usados para estudar genes e sua função em diferentes espécies modelo, tanto procarióticas como eucarióticas.
• As tecnologias empregadas na pesquisa genômica moderna.
• Métodos e protocolos de análise bioinformática em estudos de genômica funcional.
• Abordagens algorítmicas, matemáticas e estatísticas subjacentes às ferramentas de bioinformática e análise genômica.
• Tecnologias de banco de dados para armazenamento e organização dos dados.
• Técnicas de modelagem e análise empregadas em biologia de sistemas para o estudo de interações em sistemas biológicos complexos.

assuntos

A Università Degli Studi di Milano oferecerá os cursos focados em temas biológicos, enquanto o Politecnico di Milano oferecerá os de computação.

1º ano

1º semestre

• Cursos obrigatórios: Química Orgânica; Bioinformática e Biologia Computacional
• Disciplinas eletivas: Genética, Biologia Celular e Molecular; Bioquímica; Programação e bases de dados; Estatisticas

2º semestre

• Cursos obrigatórios: genômica e transcriptômica; Programação Científica; Aprendizado de Máquina; Bioestatística

2º ano

1º semestre

• Cursos obrigatórios: Genômica Avançada e Epigenômica; Química Estrutural; Biologia de Sistemas e Análise de Redes
• Cursos eletivos: projeto interdisciplinar; Gerenciamento de Big Data e Computação Genômica

Oportunidades de carreira

O mestrado BCG visa formar “cientistas de dados”, profissionais altamente qualificados, capazes de unir conhecimentos aprofundados sobre os fundamentos moleculares das ciências da vida com o conhecimento atualizado das técnicas e tecnologias atuais para bioinformática e análise genômica. Uma ênfase particular será colocada nos aspectos quantitativos e computacionais dos últimos, que se concentrarão na análise, modelagem e compreensão de sistemas biológicos. O objetivo final é formar em um contexto multidisciplinar profissionais prontos para enfrentar os desafios decorrentes das ciências biomoleculares modernas na era pós-genômica, e capazes de conjugar e integrar conhecimentos em biologia, genética, ciência da computação, engenharia da informação e estatísticas em diferentes campos da pesquisa básica ou aplicada.

Os graduados no BCG serão capazes de:

• Participe do projeto e execução de análises genômicas em grande escala.
• Identifique e extraia o significado biológico dos resultados obtidos.
• Ferramentas de design e protocolos para a análise bioinformática de diferentes tipos de dados experimentais de forma autônoma.
• Desempenhar um papel fundamental em grupos de pesquisa focados em pesquisa genômica básica ou aplicada.
• Coordenar e supervisionar projetos e grupos de pesquisa com foco em bioinformática e genômica.

Admissão

O pré-requisito para acessar o programa de mestrado BCG é um diploma de bacharelado ("Laurea Triennale") que forneça um conhecimento adequado de (1) genética, biologia molecular e bioquímica ou (2) ciência da computação, engenharia da informação e matemática. Além disso, o conhecimento da língua inglesa é obrigatório, conforme especificado abaixo. Os alunos que ainda não concluíram o bacharelado podem se inscrever se pretendem se formar antes de 31 de outubro de 2019 (veja abaixo).

Para o ano letivo de 2019-2020, um máximo de 50 alunos será admitido no programa , selecionado com base em seus conhecimentos e uma entrevista pessoal.

Requisitos de admissão

Requisitos de admissão para estudantes italianos

Os estudantes de italiano podem se inscrever no curso de mestrado do BCG, desde que satisfaçam um dos dois requisitos a seguir:

• Eles concluíram um programa de bacharelado (Laurea Triennale) em uma das seguintes classes:
  • Biotecnologia (classe L2)
  • Biologia (classe L13)
  • Agricultura e Ciências Alimentares (classe L26)
  • Ciências Farmacológicas (classe L29)

e durante seus estudos, eles adquiriram pelo menos 30 UFC em áreas biológicas (SSD BIO) com pelo menos 18 UFC em Genética (BIO / 18), Biologia Molecular (BIO / 11) e Bioquímica (BIO / 10)

OU

• Eles concluíram um programa de bacharelado (Laurea Triennale) em uma das seguintes classes:
  • Engenharia da Informação (classe L8)
  • Ciências da Computação (classe L31)
  • Física (classe L30)
  • Matemática (classe L35)

e durante os seus estudos adquiriram pelo menos 30 UFC nas áreas da informática, engenharia da informação, engenharia biomédica, matemática e / ou estatística (SSD INF / 01, INGF INF / 05, INGF INF / 06, MAT / 01). -09, e / ou SECS-S / 01), com pelo menos 6 UFC em matemática (MAT / 01-09) e pelo menos 12 UFC em uma ou mais das seguintes áreas: informática (INF / 01), informação engenharia (ING-INF / 05), engenharia biomédica (ING-INF / 06), estatísticas (SECS-S / 01).

Os mesmos critérios são aplicados aos candidatos titulares de diplomas universitários estrangeiros considerados adequados pelo Conselho de Professores, nos quais é possível identificar claramente as disciplinas e o número de créditos adquiridos para cada disciplina. Se isso não for possível, os documentos que certificam a carreira dos candidatos serão examinados detalhadamente pelo Conselho de Professores para avaliar se seu histórico está em conformidade com os requisitos anteriores.

Os alunos de graduação podem se inscrever, mas terão que obter seu diploma de bacharelado (Laurea Triennale) antes de 31 de outubro de 2019.

Requisitos de admissão para estudantes estrangeiros

• Alunos detentores do grau de licenciado numa área das descritas no ponto anterior (Requisitos para alunos italianos), onde os cursos realizados nas disciplinas obrigatórias podem ser claramente identificados juntamente com o número de horas / créditos dos cursos. Caso tal não seja possível, os documentos que atestam a carreira dos alunos serão examinados pelo Conselho de Professores a fim de avaliar se a sua formação cumpre os requisitos anteriores.

Requisitos de idioma

• Os alunos devem ser proficientes em inglês, com um nível B2 de competência. Os alunos já matriculados na Universidade de Milão e que não possuam certificado B2 ou equivalente são convidados a realizar um teste de nivelamento para comprovar seu nível de competência e comprová-lo durante a entrevista. Em casos excepcionais, os alunos sem um teste de nivelamento B2 podem ser aceitos, desde que seu nível de proficiência em inglês, avaliado durante a entrevista, seja evidentemente bom.
• Conhecimento de italiano não é necessário para atendimento. No entanto, conforme exigido pelos regulamentos, os estudantes estrangeiros terão que demonstrar ter adquirido conhecimentos básicos da língua italiana antes da dissertação final.

Seleção e Ranking

Os estudantes que satisfaçam os pré-requisitos acima mencionados serão admitidos a uma entrevista com os membros do Conselho de Ensino para a avaliação dos seus conhecimentos científicos.

A preparação pessoal adequada dos candidatos (nos seus temas de fundo), a sua capacidade de comunicação em inglês e a sua motivação são elementos decisivos para a admissão. A entrevista avaliará a expertise do candidato em temas relacionados ao seu bacharelado.

O comitê avaliará cada candidato em uma escala de 100 pontos:

• Até 50/100 pontos serão concedidos para o currículo do candidato (o tipo de bacharelado cursado, notas do exame, cursos adicionais cursados, graus adicionais, etc.)
• Até 50/100 pontos serão concedidos para a entrevista.

A pontuação mínima exigida para a admissão é de 60/100.

Para o Ano Acadêmico 2019-2020, as entrevistas para estudantes italianos e estudantes estrangeiros residentes na Itália acontecerão no Departamento de Biociências, Via Celoria 26, no dia 16 de julho de 2019, às 9h30.

Os candidatos estrangeiros que não residem na Itália e concluíram o bacharelado no exterior podem optar por uma entrevista online. No início da entrevista, os alunos devem apresentar um documento de identidade ou passaporte válido para identificação.

Inscrever-se após a admissão

Uma vez publicado o resultado, o aluno que ocupar as 50 primeiras posições da classificação de mérito deverá realizar a sua inscrição no prazo fixado no edital de concurso. Posteriormente, se após o prazo inicial as primeiras 50 vagas disponíveis não ficarem saturadas, será possível a inscrição de alunos com menor classificação de mérito, desde que tenham atingido no mínimo 60/100 no teste de admissão. A inscrição dos alunos de graduação só será validada se obtiverem o diploma de bacharelado (Laurea Triennale para alunos italianos) até 31 de outubro de 2019. Os alunos de outras universidades, ao se formarem até 31 de outubro de 2019, devem apresentar a certificação do grau concedido na Segreteria Studenti.

assuntos

A Università Degli Studi di Milano oferecerá os cursos focados em tópicos biológicos, enquanto Politecnico di Milano oferecerá os computacionais.

1º ano

1º semestre

• Disciplinas obrigatórias: Química Orgânica; Bioinformática e Biologia Computacional
• Disciplinas eletivas: Genética, Biologia Celular e Molecular; Bioquímica; Programação e Bases de Dados; Estatisticas

2º semestre

• Disciplinas obrigatórias: Genômica e Transcrição; Programação Científica; Aprendizado de Máquina; Bioestatística

2º ano

1º semestre

• Disciplinas obrigatórias: Genômica e Epigenômica Avançadas; Química Estrutural; Biologia de Sistemas e Análise de Rede
• Disciplinas eletivas: Projeto interdisciplinar; Gerenciamento e computação genômica de Big Data

Classificações QS 2023 (junho de 2022)

• 1º na Itália
• 139º no mundo

Ao frequentar os cursos ministrados na licenciatura BCG irá aprender sobre:

1. A organização da informação no genoma e os processos moleculares e celulares na base da expressão gênica e sua regulação.
2. Os métodos experimentais utilizados para estudar genes e sua função em diferentes espécies modelo, tanto procarióticas quanto eucarióticas.
3. As tecnologias empregadas na pesquisa genômica e epigenômica moderna, como ensaios baseados em sequenciamento de última geração (sequenciamento de genoma e exoma, sequenciamento de RNA, ChIP-Seq e assim por diante).
4. Métodos e protocolos de análise bioinformática em estudos de genômica funcional (sequenciamento de genoma e exoma, sequenciamento de RNA, ChIP-Seq, etc).
5. As abordagens algorítmicas, matemáticas e estatísticas subjacentes à bioinformática e às ferramentas de análise genômica.
6. Tecnologias de banco de dados para o armazenamento e organização dos dados.
7. Técnicas de modelagem e análise empregadas em biologia de sistemas para o estudo de interações em sistemas biológicos complexos.

O programa inclui, como passo fundamental na formação dos alunos, um estágio em laboratórios de pesquisa na Universidade de Milão, no Politécnico ou em outros institutos de pesquisa italianos ou estrangeiros. A experiência de pesquisa do estágio e seus resultados serão descritos em uma dissertação final escrita, a ser discutida em frente a um comitê de tese.

O mestrado BCG visa formar “cientistas de dados”, profissionais altamente qualificados capazes de mesclar conhecimentos aprofundados sobre os fundamentos moleculares das ciências da vida com conhecimentos atualizados das técnicas e tecnologias atuais para bioinformática e análise genômica. Será dada especial ênfase aos aspectos quantitativos e computacionais dos posteriores, que serão focados na análise, modelagem e compreensão de sistemas biológicos. O objetivo final é formar em um contexto multidisciplinar profissionais prontos para enfrentar os desafios decorrentes das ciências biomoleculares modernas na era pós-genômica e capazes de conjugar e integrar conhecimentos em biologia, genética, informática, engenharia da informação e estatísticas em diferentes áreas de pesquisa básica ou aplicada.

Os licenciados no BCG poderão assim:

• Participe do projeto e execução de análises genômicas em larga escala.
• Identificar e extrair o significado biológico dos resultados obtidos.
• Projete ferramentas e protocolos para a análise bioinformática de diferentes tipos de dados experimentais de forma autônoma.
• Desempenhar um papel central em grupos de pesquisa focados em pesquisa genômica básica ou aplicada.
• Coordenar e supervisionar projetos e grupos de pesquisa com foco em bioinformática e genômica.